報(bào)告題目:Multi-scale modeling of 3-D chromatin structures
報(bào) 告 人 :高毅勤教授
報(bào)告時間:2018年1月17日(周三)上午9:00
報(bào)告地點(diǎn):化學(xué)樓一號會議室
邀 請 人:楊利明教授
報(bào)告人簡介:
高毅勤,北京分子科學(xué)國家研究中心副主任。北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院院長,教育部“長江學(xué)者”特聘教授,北京大學(xué)生物動態(tài)光學(xué)成像中心研究員,國家杰出青年科學(xué)基金獲得者。1993年本科畢業(yè)于四川大學(xué)化學(xué)系,1996年在中科院化學(xué)所獲得碩士學(xué)位, 2001年獲得加州理工學(xué)院博士學(xué)位。2001年-2004年間在加州理工學(xué)院和哈佛大學(xué)做博士后研究。2005年-2009年,美國得克薩斯農(nóng)工大學(xué)化學(xué)系助理教授。2010-現(xiàn)今,北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院教授。他的研究領(lǐng)域是理論和計(jì)算化學(xué)。致力于發(fā)展理論與計(jì)算方法研究染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和生物功能,生物分子的溶液構(gòu)象,生物酶催化機(jī)制和化學(xué)反應(yīng)中的溶劑化效應(yīng)。已在Science, Cell, PNAS, JACS等雜志發(fā)表SCI論文100余篇。在國際和國內(nèi)學(xué)術(shù)會議上和科研機(jī)構(gòu)做大會和邀請報(bào)告150余次。曾獲Pople Medal, 日本化學(xué)會Keynote Lecturer獎,美國Searle Scholar,Dreyfus新教授獎和Clauser Prize等。擔(dān)任ACS Central Science, Chemistry of Materials, Journal of Chemical Physics,Interdisciplinary Sciences, 物理化學(xué)學(xué)報(bào)等期刊的編委。
報(bào)告摘要:
Chromosome structure is essential in many biological studies. Recent Hi-C experimental studies have been dramatically deepening our understanding of the 3D chromatin. In this talk, we describe the modelling of the chromatin structure utilizing experimental Hi-C data, which provides the spatial details of chromatin. By mapping a plethora of genome features onto the chromatin model, we quantitatively and systematically reinforce the importance of chromatin architecture for genome function. We find that the colocalization of genome features on a linear map coincides their 3D segregation, and thus the latter provides a mechanism for the regulation of various genome properties. Especially, we will discuss the effects of DNA methylation on the structure of DNA and that the overall DNA methylation patter reflects the 3-D organization of the human chromatin.